創建于1986年12月，是由院內文學所、情報所、世經所和圖書館的有志于明清小說研究的同志組成的跨所的開放式、多功能、事業型的研究實體，并聘請院外有關高校、科研機構的有成就的專家數十名為特約研究員。主任：盛思明（省社會科學院副院長）；副主任：周鈞韜（常務）、歐陽健。由明清小說研究中心牽頭，組織全國十八個省市一百多名專家通力合作，編纂成功的三百多萬字的巨型學術著作《中國通俗小說總目提要》，于1990年出版，受到海內外專家學者的高度評價，稱它是“一部繼往開來的基礎工程”，是“中國小說研究史上的里程碑式的著作”，“具有極大的學術、資料、工具價值”。明清小說研究中心和江蘇省社科院文學所共同主辦的大型學術季刊《明清小說研究》，以“發現、開拓、深化”為宗旨，已出版18期，成為堅持正常出版的中國唯一的專門研究明清小說的學術刊物，越來越受到海內外學術界的重視和歡迎。明清小說研究中心自1986年起，逐年編輯《明清小說研究年鑒》，以及時全面反映全國明清小說研究的概貌，總結明清小說研究的成功經驗，并為今后研究的深化提供有益的借鑒。由于經費的原因，第一卷將延至1991年出版，以后可望逐步走向正常。中心還與省明清小說研究會合編了《明清小說研究信息》，為研究界提供有益的服務。中心于1987年5月在南京和中國文聯出版公司聯合主辦了中國古代通俗小說研討會， 交流有關古代通俗小說研究的成果，并討論《中國通俗小說總目提要》編纂中的學術問題和技術問題。1990年2月， 中心又和其他九個單位聯合承辦了海峽兩岸明清小說金陵研討會，產生了深遠的影響。研究中心始終重視自身研究工作的新的拓展和突破，成立四年來，已完成有關明清小說的專著近十種，發表論文一百余篇，整理校點明清小說作品多種。今后，明清小說研究中心還將進一步爭取做好對外開放的工作，建立中外學者的合作，以及中外資料的交換，籌辦國際明清小說學術討論會等。